1. 高温
高温消毒一般采用加热温度大于 100 ℃，并持续时间15min以上，使包括细菌、病毒在内的微生物机体蛋白质组织变性而达到杀灭细菌、病毒的目的。
高温消毒柜的加热方式一般是采用远红外线方式，电热元件通过加热空气或产生辐射热，食具受高温持续作用一段时间后，表面的细菌、病毒等微生物机体蛋白质组织变形，从而被杀灭。
一星级消毒柜要求消毒柜内温度达 100 ℃以上，并持续时间 15min 以上，可杀死大肠杆菌、金黄色葡萄球菌等细菌，杀灭率达 99.9 ％，但不可杀灭乙肝病毒；二星级消毒柜要求消毒柜内温度达 120 ℃以上，并持续时间 15min 以上，除可杀死大肠杆菌、金黄色葡萄球菌等细菌外，还可杀灭乙肝病毒和脊髓灰质炎病毒等病毒，杀灭率达 99.9 ％。但对无机化学毒物及少数特殊的生物病毒就不起作用了。高温方式消毒比较容易理解，也比较直观，这里就不多介绍。其缺点是功率偏大，容易导致温度不均匀，温度高易使腔体、密封件及加热物体损坏和变形，易使面板、拉手产生过高的温度，存在一定的安全隐患。
2. 紫外线
紫外线是波长在可见范围之外的短波， 根据辐射学原理产生的一种可见“蓝色光”，是不起消毒作用的 。紫外线按波长范围可分为 a 、 b 、 c 三个波段和真空紫外线。
·a 波段 320 ～ 400nm
·b 波段 275 ～ 320nm
·c 波段 200 ～ 275nm
·真空紫外线 100 ～ 200nm
其中真正具有杀菌作用的是 c 波紫外线，尤以波长 253.7nm 的紫外线最佳。紫外线可以杀灭各种微生物，包括细菌繁殖体、芽胞、分支杆菌、病毒、真菌、立克次体和支原体等，具有广谱性。
其杀菌原理是通过紫外线对细菌、病毒等微生物的照射，以破坏其机体内 dna （去氧核糖核酸）的结构，使其立即死亡或丧失繁殖能力。 dna 对波长 253.7nm 的紫外线吸收最强。紫外线的杀菌效果与其照射强度和总的照射量有关，一般可达杀灭率≥ 99 ％。照射剂量（照射强度和照射时间的乘积）增加时，杀死细菌的数量增多，但被杀死细菌的百分比并不与照射剂量成比例的增加。相当小的剂量也可杀死少数细菌；如细菌量多，甚至用相当大的剂量照射仍有部分细菌免于死亡。
其缺点是紫外线只能沿直线传播，辐射能量低，穿透力弱，仅能杀灭直接照射到的微生物，因此消毒时尽量应使消毒部位充分暴露于紫外线下。
由于消毒柜本身的结构和碗盘置放排列较密的特点，紫外线辐射被碗盘自身遮挡，碗盘的许多部位不能被紫外线光照射，这些部位的细菌、病毒将不能被紫外线杀死，因此，国家标准规定，食具消毒柜不能仅以紫外线作为单一的消毒手段。
通常，直接接触紫外线，对人们是有伤害的。但是普通玻璃和钢化玻璃的紫外线透光率只有 0.01~0.1% 。因此，使用是绝对安全可靠的。 由于紫外线辐射对人体有害，因此绝对不允许有泄漏，如能从机器任何不透光部位直接看到紫外线，应立即停止使用，检修。
