根据国家法律和相关标准要求，微生物指标为产品出厂必检项目。而当前国家标准检测方法由于检测周期长，对检验人员能力要求高等原因，在食品企业内没有很好地开展，而在巴氏杀菌乳和发酵乳等保质期短的产品出厂检验中，不进行致病菌检测已经是行业潜规则。

调研发现，现行标准的执行存在以下困难：首先，人为干扰：大量人工操作、主观判断因素等导致批间差异较大，缺乏重现性。其次，交叉污染：微生物环境、人员、器具和仪器之间易产生交叉污染。再次，经验缺乏：专业人员的培训困难、耗时。同时实验室检验人员的资质、经验和主观判断力也极大影响了数据可靠性和检验结论的正确性。后，方法存在许多局限：1、灵敏度和特异性低，漏检率高：如沙门氏菌检出率比分子生物学方法低12.5，大肠杆菌o157:h7检出率低45.3。国内食源性致病微生物监测能力有限，漏检率极高。who显示，发展中国家的漏检率>;95。2、培养基质量：国内的培养基质量层次不齐，影响检测结果。3、食品种类对检出结果影响大：检测结果易受抽样品种和抽样量影响。目前许多检测法都没通过权威机构的方法确认，可靠性得到不到保障。4、背景菌干扰或目标菌的状态问题突出：目标菌受背景菌干扰或处于非典型状态，很难被培养和检出。某些目标菌表型和血清型复杂，阳性菌落易被忽视或难以确认。5、任务繁重，工作量大而集中。6、人力、物力、时间成本大，传统法检测致病菌需要3—5天才能得到初步结果，无法满足大工作量和处理突发事件的需要。

对乳品企业而言，自身的环境监测和生产过程控制比样品检测更为重要。确保厂区内洁净作业区的设施和环境不会对产品带来微生物污染，才能真正保证产品安全。而传统的方法很难满足微生物风险评估、监测和污染溯源的需求。面对日益严峻的微生物风险的挑战，面对如此之多棘手的检测难题，面多越来越严格的法规要求，乳品企业急需基于dna分析技术的高效检测设备以满足未来的应用需求。

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