实现厂网分开、竞价上网和全国联网后，水电表现出明显的低成本竞争优势，将迎来快速发展，其发电量和在电力结构中的比重将不断提高。但受各方面条件的限制，中国未来很长一段时期仍将以燃煤发电为主，预计到2050年，燃煤电厂发电量仍然要占50%左右。不过，尽管燃煤电厂的发电量在电力结构中的比重将不断下降，但绝对数还将继续提高。
在发电公司实行竞价上网时，水电公司的优势最为明显。水电与火电在每kw造价方面相比较水电大约为7000~100000元，30~60万kw国产机组的火电为5400~6300元，进口的66万kw机组为7200~8200元，水电比火电高约40%。尽管水电的建设成本高于火电，但是随着国家对环保的控制要求的提高，如果考虑到火电厂脱硫、脱硝、脱尘等环保求所需资金（约占总投资的1/3），单位kw火电建设成本比水电低的优势差水多丧失殆尽。而水电的长运营期和低运行成本却是火电站远远不及的。目前，国内水电公司运行成本一般是0.04~0.09元kw·h。火电厂由于需源源不断地购买和运输大量燃料，而这方面的费用约占火力发电总成本的60%~70%，致使目前火电运行成本高达0.19元/kw·h左右，随着煤炭价格的上涨火电厂的发电成本还将上升。
至于其他能源如核能、风能在中国尚属新技术，对国外技术依赖性很大，成本都比较高。所以，在发电公司实行竞价上网时，水电公司的优势最为明显。
中国水电开发利用的潜在优势要真正变为现实，还需要政府进一步的政策支持。
然而，建设水电特别是大型水电投资大，工期长，资金回收慢，风险是显而易见的。比如建设期的水文、地质方面的自然风险。因而过去相当长一段时间中水电建设力度不足，造成水力资源没有得到充分开发利用，开发利用率只有20%左右，尚有80%的水力资源等待开发，其中水力资源总量占全国82.5%以上的西部地区开发利用程度更低。所以，中国水电发展潜力巨大。
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