第七届世界微生物数据中心学术研讨会近日在京举行。会上,由世界微生物数据中心(wdcm)和中科院微生物所牵头,联合美、德、日、中等12个国家的微生物资源保藏中心共同发起的全球微生物模式菌株基因组和微生物组测序合作计划启动。合作计划将建立覆盖20多个国家30个主要微生物资源保藏中心的微生物、微生物组基因测序和功能挖掘合作网络。
据悉,目前世界上已知微生物物种有1.4万余种。此次合作计划将在5年内完成超过1万种微生物模式菌株基因组测序,覆盖超过目前已知90%的细菌模式菌株。计划还将完成超过1000个微生物组的样本测序,覆盖人体、环境、海洋等主要方向。
wdcm主任、微生物所微生物资源与大数据中心马俊才说,测序可让微生物基因组学分类学更完善,探索具体环境中微生物之间以及微生物与环境之间的相互作用,其分析结果有助于推动科学发展和产业应用。会上,欧洲微生物保藏组织理事长nelson lima表示,全球微生物资源中心(mbrc)仍面临诸多挑战,如已知微生物物种不足其多样性的1%,储存的分离菌还存在质量控制、数据整合等挑战。这些需要全球科学界与生物技术产业界之间通力合作。
据介绍,通过实施此次合作计划,我国将牵头建立微生物领域的国际标准,搭建微生物组学国际权威的数据平台。基因测序的应用领域正在迅速扩大,仅肿瘤诊断与治疗领域就有望成为千亿级市场,测序仪器和试剂国产化前景受到各界关注。
来源:仪器交易网
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